Nội soi chỉ kiểm tra bất thường cấu trúc (loét, polyp, ung thư) niêm mạc dạ dày/đại tràng. Nhưng trên 70% khó tiêu là khó tiêu chức năng do giảm nhu động, tăng nhạy cảm tạng và mất cân bằng thần kinh tự chủ. Đông y chẩn đoán là đàm tích, khí trệ và điều trị tương ứng.